Canlı sistemlerde hidrojen bağı, hidrojenin daha elektronegatif bir atoma bağlanmasıdır. Proteinler ve nükleik asitler gibi organizmalardaki birçok organik molekül, doğru şekilde çalışması için hidrojen bağlanmasına bağlıdır. >
Oksijen ve florin içeren elektronegatif elementler elektronlarını sıkıca tutma eğilimindedir. Elektronegativite, bir atomun elektronları ne kadar çektiğinin bir ölçüsüdür. Elektronegatif atomlar diğer atomlarla bağlar oluşturduklarında elektronları daha sert çekerler. Elektronlar, daha fazla elektronegatif atomun etrafında dönen daha fazla zaman harcarlar. Bu eşit olmayan elektron dağılımı, bileşiklerde kısmi negatif ve kısmi pozitif yük alanlarına neden olur.
Hidrojen bağı, DNA molekülünün dağılmasına ve proteinlerin katlanma düzenine neden olur. Proteinlerde, hidrojen bağları proteinin işlevi için önemli olan üç boyutlu bir yapıya katlanmasına izin verir. DNA'da molekülün iki tarafı hidrojen bağları ile bir arada tutulur.
