Boşaltım sisteminin ana organları cilt, akciğerler, böbrekler, karaciğer, idrar sistemi ve kalın bağırsaktır. Bu organlar atık ve fazla maddeleri vücuttan atma işlevi görür , ancak boşaltım sistemi resmi bir anatomik sınıflandırmaya sahip değildir.
Cilt, vücudun en büyük organıdır ve ter ile vücut israfını ortadan kaldırır. Bu, vücudun sıcaklığını düzenlemeye yardımcı olur ve boşaltım sisteminin asgari bir parçasıdır. Bir kişi soluduğunda, ciğerler kandaki karbondioksiti dışarı atar, bu yüzden solunum, boşaltım sisteminin bir işlevidir.
Böbrekler, mesane ve idrar yolu idrar sisteminin bir parçasıdır ve kombinasyon halinde idrar formunda aşırı azot, üre, tuz ve su kanlarından kurtulurlar. Karaciğer boşaltım sistemi için iki işlevi yerine getirir. İlk olarak, toksinleri parçalar ve amonyağı üre haline dönüştürmek gibi onları dönüştürür; böylelikle böbrekler yoluyla idrarla atılır. Karaciğer ayrıca yağı kıran safra yapar. Safra daha sonra safra kesesi içinde saklanır ve yağ ve etanolü parçaladığı ince bağırsakta salınır.
Kalın bağırsak, fazla suyu bağırsaktan geçerken atıklardan uzaklaştırır. Kalan katı atık daha sonra atılır.