Boşaltım sistemi, vücuttan fazla azot ve diğer toksinlerin çıkarılmasıyla görevli organlardan oluşan bir koleksiyondur. Böbrekler, karaciğer ve kalın bağırsak filtrasyon görevlerinin çoğunu yerine getirir. Katı atıklar kolondan dışarı taşar, gazlı atık vücuttan ciğerlerden çıkar ve fazla sıvı madde mesaneden ve ciltten çıkar.
Boşaltım işlemi, karaciğer safra yarattığında, safra kesesine ve alt bağırsağa geçerken başlar. Safra katı atıkları parçalamaya başlar ve amonyak gibi maddeleri daha az zararlı üre haline getirebilir. Safra ayrıca faydalı yağları atık ürünlerden ayırarak lipitleri parçalamada önemli bir rol oynar. Üre, tuzlar ve azot yan ürünleri kan dolaşımına emilir. Burada böbreklere geçer ve mesaneye süzülür. Fazla su da cilde yönlendirilebilir. Orada ter bezlerinden akar ve buharlaşır, onunla tuz ve diğer kirleticileri alır.
Kalan katı madde, ince bağırsaktan kalın bağırsaktan geçer, kalan suyun çıkarılması ve mesaneye iletilmesi. Kalan katı atık, dışkı maddesine dönüştürülür ve kolondan vücuttan geçer.