Bazı basit protein örnekleri histonlar, globulinler, glutelinler, albüminoidler ve albüminlerdir. Bu proteinler hidroliz işlemi ile kimyasal olarak suyla parçalandığında, genellikle yalnızca amino asitlere ayrılırlar. Bazen, aynı zamanda küçük karbonhidrat bileşikleri içerdikleri bulunur.
Histonlar, DNA'nın yoğunlaşmasında yardımcı olan proteinlerdir, böylece çekirdeğin içine kromozom şeklinde sığabilir. Bazı histonlar, DNA'nın etrafından sarıldığı makara benzeri yapılar olarak işlev görür. Bu proteinlerin negatif yüklü DNA'ya yakalanmalarını sağlayan pozitif bir yükü vardır.
Globulinler, gamma globulinler, enzimler ve taşıma proteinleri olarak adlandırılan antikorlardan oluşan basit proteinlerdir. Kan testlerinde düşük globulin seviyeleri nefroz, karaciğer fonksiyon bozukluğu ve akut hemolitik anemi gibi durumlar ile ilişkilidir. Buna karşılık, yükseltilmiş globülin seviyeleri, bazıları parazitik enfeksiyonları, romatoid artrit, böbrek fonksiyon bozukluğu, lösemi ve bazı bakteriyel ve viral enfeksiyonları içeren çok çeşitli koşulları işaret edebilir.
Basit proteinlerin aksine, konjuge proteinler hem amino asitleri hem de protein olmayan bileşenleri içerir. Nükleoproteinler, fosfoproteinler, lestoproteinler ve glikoproteinler, konjuge proteinlerin birkaç örneğidir. Bu arada, türetilmiş bir protein, basit veya konjuge bir proteinin fiziksel veya kimyasal değişimi yoluyla oluşturulur. Peptitler ve denatüre proteinler bu türetilmiş proteinler kategorisine girer.
