Anaerobik solunum örnekleri nitrat azaltma, denitrifikasyon, sülfat azaltma ve karbonat azaltma içerir. Bu yöntemlerin tümü oksijen dışında bir elektron alıcısı kullanır ve membran bağlı bir elektron taşıma sistemine sahiptir. Bu anaerobik mekanizmalar ayrıca adenozin trifosfat veya ATP'yi ATP sentaz yoluyla sentezler.
Nitrat indirgemesinde organizmalar, terminal elektron alıcısı olarak oksijen yerine nitrat kullanır. Bu işlem verimsiz olduğundan, nitrat indirgemesi kullanan organizmalar bunu ancak oksijenin nitrattan önemli ölçüde daha fazla mevcut olduğu durumlarda yaparlar. Denitrifikasyon, organizmaların daha fazla altı elektron kabul edebilen nitratı nitrojen gazına daha da düşürmesini sağlayan ilgili bir işlemdir. Denitrifikasyonun toksik yan ürünleri organizma tarafından, çok sayıda gen içeren karmaşık bir proseste dikkatlice düzenlenir. Denitrifikasyonun karmaşıklığından dolayı, birkaç organizma kullanabilmektedir. Denitrifikasyon, çoğu bitki azot gazı kullanamadığı ve bunun yerine topraktaki nitratı kullandığı için küresel azot döngüsü üzerinde de bir etkiye sahiptir.
Sülfat indirgemesi, tamamen oksijensiz ortamlarda yaşayan organizmalar tarafından kullanılır. Sekiz elektron, genellikle hidrojen sülfit haline gelen sülfata eklenir. Nitrattan daha düşük bir enerji verimiyle, sülfat indirgemesi ATP'yi sentezlemek için sadece yeterli miktarda enerji verir. Hidrojen gazı ve asetat ve laktat gibi küçük organik asitler ortak sülfat indirgenleridir. Karbonat indirgemesi nispeten yetersizdir, ancak karbonat doğada yaygındır. Bu anaerobik sürecin, Archaea üyeleri tarafından kullanılan en eskilerden biri olduğuna inanılıyor.
