Deniz yosunu tek bir krallığa değil, farklı evrimsel süreçlerden dolayı birkaç farklı ülkeye aittir. Bu krallıklar, Kingdom Plantae, Kingdom Chromista ve Kingdom Bacteria'yı içerir.
Thallusun rengiyle ayırt edilebilen üç filizi yosun vardır. Filumda deniz yosunu Ochrophyta kahverengi, filum Rhodophyta'da olanlar kırmızı ve filum Chlorophyta'da olanlar yeşildir. Rengin yanı sıra, bu üç grup yapılarında ve hücre duvarları, flagella, depolama bileşikleri, kloroplastlar, fotosentetik pigmentler, mitoz ve hücre bağlantıları gibi biyokimyasal bileşimlerinde önemli farklılıklar gösterir. Şimdiye kadar yaklaşık 11.500 deniz yosunu türü bulundu.
