Sindirim ve endokrin sistemler, sindirim enzimlerini üretmek ve yaymak için çoğunlukla pankreas yoluyla birlikte çalışır. Endokrin sistem, hipotalamus, hipofiz, paratiroid, adrenal olan birkaç farklı organ ve bez içerir bezleri, üreme bezleri, tiroid ve pineal vücut. Endokrin sistemin birincil rolü, sindirim sistemine ne zaman yiyecek sindirmeye başlayacağını ve ne zaman duracağını söyleyen önemli hormonlar üretmektir.
Endokrin sistemdeki bezlerin çoğu vücuttaki ana hormon üreticileridir, ancak kalp, akciğerler, beyin, böbrekler, karaciğer, timus ve cilt gibi bazı organlar da salınan hormonları üretir vücudun her yerinde. Endokrin sistem, sindirim sistemine ne zaman çalışmaya başlayacağını söylemek için pankreastan sinyal göndermenin yanı sıra, zaman içerisinde ruh halini, gelişmeyi ve büyümeyi kontrol etmeye ve dengelemeye yardımcı olur. Endokrin sistem aynı zamanda uygun doku fonksiyonunu da destekler ve cinsel fonksiyon ve üremenin kontrolünde büyük rol oynar. Endokrin sistem, nüfus arasında farklı oranlarda meydana gelen metabolizmayı düzenler. Sindirim sistemi ile sorumluluk paylaşmaya ek olarak, endokrin sistem nefes alma ve hareket gibi yaşam fonksiyonlarını kontrol eden sinir sistemi ile işbirliği yapar.