Jel elektroforezi olarak da bilinen elektroforez, DNA, RNA ve proteinlerin makromoleküllerini ayırmak için kullanılır. Proteinler yüklerine göre ayrılırken, DNA ve RNA büyüklük ve uzunluklarına göre ayrılır.
Elektroforez, adli tıp, babalık testi, PCR reaksiyonlarının kontrolü, hastalık tespiti ve organizmalar arasındaki evrimsel ilişkilerin araştırılması için parmak izi için DNA'da kullanılır. Negatif yüklü DNA moleküllerinin bir çözeltisi, bir elektrik alan kullanılarak jel içinden çekilir. Daha küçük DNA molekülleri, daha büyük DNA moleküllerinden daha hızlı jel içinden çekilir. Bu, farklı boyutlarda DNA molekülleri içeren bir dizi bant oluşturur. Jelin başlangıcından uzakta olan bantlar, en küçük DNA fragmanlarını içeren gruplardır, en büyük DNA fragmanlarını içeren gruplar jelin başlangıcına en yakın olanlarıdır.
Proteinlerin sağladığı bilgileri belirlemek için çeşitli elektroforez jelleri kullanılır ve kullanılan jel türü ihtiyaç duyulan bilgiler tarafından belirlenir. Proteinler, proteinlerin yapısı için yapı taşları olarak görev yapan çeşitli amino asitleri içerir. Proteinlerin içerdiği amino asitlerin sayısı ve proteinlere eklenen kimyasal modifikasyonların büyüklükleri belirlenir. Proteinlerin ayrıca söz konusu protein türüne bağlı olarak farklı şarjları vardır.
