Bir su ekosisteminin ötrofikasyonu, sisteme besinlerin eklenmesi yavaşlatılarak yavaşlatılabilir veya tersine çevrilebilir. Fazla besin kaynakları, etkilenen ekosisteme girmekten fiziksel olarak engellenebilir. Alternatif olarak, bu kaynaklar etkilenen ekosistemin yukarısındaki bir noktada besinleri uzaklaştırmak için işlenebilir.
Su kaynakları, çoğunlukla fosfor ve azot olmak üzere mevcut besin maddelerinin artmasından dolayı ötrofik olur. Bazı yüksek besin değerindeki atık akarsuları göllere ve nehirlere kazara girerler; diğerleri kasıtlı olarak istenmeyen materyalleri elden çıkarmanın bir aracı olarak atılır. Yaygın besin kaynakları tarımsal gübre ve gübre akışları ve belediye atık sularıdır.
Toprak işleme, azaltılmış gübre uygulaması ve örtü kırpma gibi tarım uygulamaları, gerçekleşen gübre akış miktarını en aza indirmeye yardımcı olur. Çitler ve vejetatif tampon bölgeleri ayrıca toprak ve suda çözünür gübrenin tarım alanlarından çıkmasını ve göllere ve akarsulara girmesini önler. Düzgün bir şekilde tutulan, işlenen ve yönetilen ve doğrudan göllere ve nehirlere akmayan tarımsal gübre kaynakları ötrofikasyonu önlemeye yardımcı olur. Sığırların ve diğer hayvanların akarsular ve nehirlerin yakınında otlatma veya yürüyüş yapmasının engellenmesi de önemlidir. Özel bir ev sahibi, kullandığı çim gübresi miktarını azaltabilir ve fosfat bakımından düşük çim bakım ürünlerini kullanabilir.
