DNA'nın iki tarafı, hidrojen bağlarıyla bir arada tutulur. Bu bağlar, ilk olarak 1953'te bilim adamları James Watson ve Francis Crick tarafından önerilen karakteristik çift sarmal yapıya katkıda bulunur. DNA içinde bulunan bazlar.
DNA'nın yapısına katkıda bulunan azotlu bazlar, adenin, timin, sitozin ve guanindir. Her adenin, timin ile iki hidrojen bağı oluşturur ve normal koşullar altında sitozin veya guanin ile etkileşime girmez veya bağlanmaz. Benzer şekilde, sitozin, guanin ile üç hidrojen bağı oluşturur ve timin veya adenin ile etkileşime girmez. Bazlar arasındaki yanlış hidrojen bağı, DNA uyumsuzluğu onarımı adı verilen bir işlemle tanınması ve düzeltilmesi gereken hatalara yol açabilir.