Mekanik sindirim, yiyecekleri daha büyük bir yüzey alanına sahip daha küçük parçalara bölerek kimyasal sindirim işlemine başlamak için enzimler ekleyerek kimyasal sindirime yardımcı olur. İnsanlarda, ağızda çiğneme yoluyla mekanik sindirimin çoğu gerçekleşir, bu sırada dişler gıda maddelerini parçalar.
Çiğneme sadece yiyecekleri parçalamakla kalmaz, aynı zamanda hem enzimleri hem de mukus içeren tükürük ile karıştırır. Enzimler öncelikle karbonhidratları parçalamak içindir. Mukus çiğnenmiş gıda partiküllerinin bolus olarak bilinen yarı katı bir kütleye yapışmasına yardımcı olur ve yutulması orijinal gıda maddesiyle olduğundan daha kolay olur. Daha fazla mekanik ve kimyasal sindirimin meydana geldiği mideye doğru ilerler.
Mide, bolusu peristalsis olarak bilinen bir işlemle, bolusu parçalayan ve onu mide asidi ve daha fazla enzimle, özellikle proteinleri parçalayan pepsinle karıştıran bir işlem yoluyla bolusu mekanik olarak parçalamaktadır. Bu işlem bolusu kekik olarak bilinen bir maddeye böler. Kekik, midenin dibinden salınır ve içindeki mide asitleri nötralize edilir. Bağırsakların üst kısmındaki sıvılar, başka bir mekanik sindirim şekli olan yağı emülsiyon haline getirir. Bağırsaklar ayrıca karbonhidratları ve proteinleri parçalamak için başka enzimler de içerir.
