Jüpiter'in ortalama sıcaklığının eksi 145 C olduğuna inanılıyor. Bununla birlikte, gezegenin sıcaklığı geniş ölçüde değişir ve merkezdeki en sıcak yerlerden biridir.
Jüpiter'in çoğu gazdan yapılmış, bu yüzden üzerine düşen bir madde çekirdeğine düşecek. Düşen cisme verilen basınç arttıkça sıcaklığı da artar. Çekirdeğinde Jüpiter'in yaklaşık 35.000 C olduğuna inanılıyor ve içerdiği hidrojeni sıvı yapmak için basınç yeterli. Jüpiter'in çekirdeği yalnızca güneş açısından sıcaklık açısından ikinci sırada.