Yalıtılmış bir koloni, genellikle steril bir petri kabına veya besleyicili bir cam sürgüne bir örnek yerleştirerek diğer kirleticilerden izole edilmiş bir bakteri kolonisidir. Bu işlem, herhangi bir gözlem veya deneyin ücretsiz olmasını sağlar dışarıdan biyolojik kirleticilerden. Bu koloniye genellikle "saf kültür" denir.
En saf kültür, tek bir hücreden türetildiği için, biyologlar izole edilmiş koloniler oluşturmak için büyük uzunluklara gidebilirler. İlk kültür kirlenmiş olarak kabul edilir. Besin besiyerine yayılır, genellikle basitçe kayar veya çanak üzerine dizilerek. Doğru yapılırsa, bu, hücrelerin bölünmesinin, daha sonra saf bir kültür olarak başka bir slayta taşınabilecek küçük izole edilmiş koloniler oluşturmasını sağlar. Saf kültürler oluşturmak için başka bir yöntem, bakteri numunelerinin suda çözülmesini ve daha sonra tek bir izole edilmiş bakteri ile bir damlacık bulmak için bir mikroskop kullanmayı içerir. Bu bakteri daha sonra koloniyi oluşturmak için bir su besin çözeltisine bırakılır.
Yalıtılmış bir koloni geliştirildikten sonra, çeşitli amaçlar için kullanılabilir. Tıbbi laboratuvarlarda, izole edilmiş koloniler sıklıkla hastalığı tanımlamak ve teşhis etmek, bir kanser hücresi numunesinin niteliklerini incelemek veya bakteriyle mücadelede en etkili antibiyotiklerin ne olduğunu belirlemek için kullanılır. Genetik laboratuvarları bu örnekleri rekombinant DNA ile denemek veya spesifik genleri aramak için kullanır.