Klorun üç adet dolgulu veya kısmen dolgulu elektron yörünge kabukları vardır. Elektron yapılandırması 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5'tir, yani birinci ve ikinci elektron yörünge kabukları doldurulur ve üçüncü elektron yörüngesi kabuğudur kısmen doldurulmuş.
Klorun atom numarası 17 olan, on yedi elektron taşıdığı anlamına gelir. Birinci elektron orbital kabuğunun maksimum iki elektron kapasitesi ve ikinci elektron orbital kabuğunun maksimum sekiz elektron kapasitesi olduğu için, bir klor atomunun ilk iki elektron orbital kabukları doldurulur. Üçüncü kabuğun kapasitesi on sekizdir, ancak bir klor atomundaki üçüncü kabuk sadece yedi elektron içerir.
