İsviçre peyniri delikleri vardır, çünkü peynirin dilimlendiğinde sertleştikçe peynirin içinde oluşan karbon dioksit kabarcıkları oluşur. İsviçre peyniri kültüründe kullanılan bakteri türlerinden biri metabolizmasının bir parçası olarak karbondioksit üretir.
İsviçre veya Emmentaler peyniri üretiminde kullanılan çeşitli bakteri türlerinden biri olan Propionibacterium freudenreichii, peynir kürlenirken laktik asidin fermantasyonundan karbon dioksit üretir. Bu bakteri İsviçre ve Emmentaler peynirlerinde diğer peynir çeşitlerinden daha fazla miktarda bulunur, bu peynirlerde baloncukların neden diğer peynirlerde olduğundan daha belirgin olduğunu açıklar.
