Filogenetik tür kavramı, bir türü ortak bir atayı paylaşan ve bu atayı paylaşmayan diğer organizmalardan ayırt edilebilen bir grup organizma olarak tanımlar. Bir benzetme olarak filogenetik tür kavramı hayat ağacında, türler uzak dallardır. Bu, başarılı bir şekilde iç içe geçebilecekleri takdirde organizmaların aynı türden olduğunu iddia eden biyolojik tür kavramı ile çelişmektedir.
Bilim adamları henüz “türler” terimi için mükemmel bir tanım tasarlamamışlardır. Filogenetik tür kavramı, mevcut seçim kavramı olan biyolojik tür kavramı için önerilen alternatiflerden biridir. Bir fil ve bir farenin farklı türler olduğunu belirlemeye çalışırken biyolojik türler kavramı mantıklı olsa da, bütün türler arasında geçerli bir gösterge olamaz. Birçok sürüngen, açıkça açıkça farklı türler olan diğer hayvan gruplarıyla üreyebilir. Bazı durumlarda, yılanlar diğer ailelerin yılanlarıyla başarılı bir şekilde beslendi.
Filogenetik tür kavramı, tartışmanın ön saflarında evrimsel ilişkileri kurar ve doğurganlıkla ilgili sorunları ortadan kaldırır. Ancak filogenetik tür kavramı diğer alanlarda da başarısız olmaktadır. Mesela, halka türleri, birbirlerinden ayrılan hayvanların bir araya gelmesi mümkün değil, aynı zamanda ortak ve benzersiz bir atayı net bir şekilde paylaşabiliyorlar. Bu, net bir şekilde farklı hayvanları temsil etmelerine rağmen, onları filogenetik olarak tek bir tür yapar.