Hidrojen en az kütleye sahip atomik parçacıktır. Atom, proton, nötron ve elektron olarak bilinen atom altı parçacıkların bir kombinasyonundan oluşur. Bu parçacıkların birleşik kütlesi atomun kütlesini belirler. Hidrojen en az atom altı parçacıklara, dolayısıyla en az kütleye sahiptir.
Yaygın bir hidrojen atomu sadece bir proton ve bir elektron içerir. Döteryum olarak bilinen başka bir hidrojen atomu formu, bir nötronun yanı sıra bir proton ve bir elektron içerir. Trityum olarak bilinen üçüncü bir hidrojen şekli, bir proton ve bir elektron ile birlikte iki nötron içerir. Bu daha az yaygın olan hidrojen formları izotoplar olarak bilinir. Bir izotop, bir atomun ortak şekliyle aynı sayıda elektron ve proton içerir ancak farklı sayıda nötron vardır.