Balina yüzgeçleri ve maymunların elleri gibi homolog yapılar, bir türün yapıları farklı amaçlar için kullanmasına rağmen, türlerin ortak bir ata paylaştığını göstermektedir. Tanım gereği, homolog yapılar atalara benzer yapılardan türetilenlere. Doğal dünya, doğal seleksiyon teorisinin tahmin etmesi gereken homolog yapı örnekleri ile doludur.
Başlangıçta, bilim adamları hayvanları genel fiziksel benzerliklerine göre grupladılar. Bu, yarasaların, tüm hayvanlar uçarken, böceklerin ve kuşların yakın akrabası olduğu kabul edildi. Bununla birlikte, modern DNA tekniklerinin doğruladığı gibi, yarasalar böcek ve kuşlarla ilgili değildir, bunun yerine kemirgenlerle ilgili memelilerdir. Kanatları, kuşların kanatlarının geliştiği aynı kemiklerden, atalarının sahip olduğu el ve kol kemiklerinden evrimleşmiştir.
Rakunların kolları, kuşların kanatları ve balina yüzgeçlerinin tasarımda birbirine benzemesi, hepsinin ortak bir atadan evrimleştiğini göstermektedir. Bir röntgende bakıldığında, üç yapının evrimi farklı şekillerde olmasına rağmen, üç yapının da çarpıcı benzerlikleri paylaşıyor. Bazen, homolog yapılar birbirlerine belirgin benzerlikler taşımazlar. Örneğin, yılanların kuadrat kemikleri uzun, incedir ve hayvanların çenelerinde bulunur. Buna karşılık, kuadrat kemikleri, memeliler için orta kulağın küçük kemiklerine dönüştü.
