FAD, sitrik asit döngüsü veya TCA döngüsü olarak da bilinen Krebs döngüsü sırasında mitokondride FADH2'ye indirgenir. FADH2, indirgenmiş bir FAD şeklidir (flavin adenin dinükleotit).
Krebs döngüsü aerobik hücresel solunum sürecinin hayati bir parçasıdır. Hücresel solunum, çok aşamalı bir işlemde gıdaların karbondioksit ve suya oksidasyonunu içerir. Her solunum adımında salınan enerji, FADH2, NADH2 ve sonunda ATP (adenosin trifosfat) içindeki kimyasal bağlar şeklinde depolanır. Krebs döngüsü, her ikisi de solunumun son aşaması elektron taşınması için yakıt görevi gören FADH2 ve NADH'nin oluşumuyla sonuçlanan sekiz reaksiyon dizisinden oluşur. Solunum işlemi tamamlandıktan sonra, NADH ve FADH2'yi tekrar NAD ve FAD'ye oksitlemek için oksijen gerekir, böylece gelecekteki Krebs çevrimlerinde tekrar kullanılabilirler. NADH ve FADH2'nin oksidasyonundan salınan enerji, hücreler için enerji kaynağı olan ATP'nin oluşumu için kullanılır.