Etanol son derece kutupsaldır. Her molekülün bir ucunda hidrojene bağlı oksijeni olan, son derece elektronegatif olan ve molekülün diğer kutupsal moleküllerle güçlü hidrojen bağları oluşturmasını sağlayan bir hidroksil grubu vardır. Etanol molekülünün diğer ucu ise kutupsal değildir.
Etanolün bir ucunda kutupsal olma ve diğerinde kutupsal olma özelliği onu çeşitli maddeler için mükemmel bir çözücü yapar. Ticari ortamlarda sudan sonra en sık kullanılan ikinci çözücüdür. Aynı zamanda bir antiseptiktir ve temas halinde birçok mikroorganizma türünü öldürebilir. Mayaların ve diğer tek hücreli organizmaların ortak bir metabolik ürünüdür.
