Elektroforez ilkesi, bir elektrik alanının varlığında yüklü bir parçacığın bir ters yük bölgesine doğru hareket ettiğini belirtir. Parçacık kimyasal bağlarında eşit olmayan bir yük dağılımına sahip olduğunda, elektrik potansiyeli üzerinde.
Bir elektrot, akımın geçmesine izin vermek için bir elektrik alanı oluşturan herhangi bir iletken malzemedir. Bir elektrotun pozitif ucuna bir anot, negatif ucuna bir katot denir. Negatif yüklü bir parçacık bir elektrik alanı boyunca hareket ettiğinde, anoda doğru göç etme ve sürtünme kuvvetine karşı hareket etme eğilimindedir. Parçacık ne kadar büyük olursa, o kadar yavaş hareket eder.
Moleküler biyoloji ve biyokimya alanlarında, elektroforez, farklı ebat ve yoğunluktaki makromoleküllerin ayrıldığı kullanışlı bir analitik tekniktir. Elektroforezden geçen kompleks proteinler ve nükleik asitler, öncelikle polimerize agaroz veya poliakrilamitten oluşan bir jel matrisinde hareket eder. Agaroz, kaynar suda çözündüğünde jelatin benzeri bir madde oluşturan bir polisakarittir. Poliakrilamid, akrilamid çözeltilerinin, tetrametilendiamin ile birleştirilmiş amonyum persülfat ilavesiyle polimerizasyonuyla oluşturulan bir katı jel türüdür.
Agaroz jeli esas olarak kompleks protein moleküllerini ve DNA veya RNA fragmanlarını ayırmak için kullanılır. Daha küçük moleküller gözenekli malzemeye karşı tutulurken daha küçük parçacıklar kolayca geçer. Modern araştırmacılar poliakrilamid jel kullanımını tercih ediyor. Diğer jel elektroforezi formları arasında izoelektrik odaklama, 2D elektroforezi, kılcal elektroforezi ve western blotlama bulunur.
