Çoğu enerji kaynağı gibi, biyokütle enerjisi de özellikle çevreye, özellikle de çevreye zarar verme potansiyeline sahiptir. Enerji için biyokütlenin sürdürülebilir olmayan oranlarda toplanması ekosistemlere zarar verebilir. Aynı zamanda zararlı hava kirliliğine neden olabilir, büyük miktarda su tüketebilir ve net sera emisyonları üretebilir.
Biyokütle enerjisi aynı zamanda iyi şeyler yapma potansiyeline sahiptir. Düşük karbonlu biyokütle, karbondioksit gibi ısı tutucu gazların emisyonlarını azaltmak için ihtiyaç duyulan yenilenebilir enerjinin önemli bir kısmını sağlayabilir. Biyokütle sürdürülebilir bir şekilde üretildiği sürece, biyokütle enerjisi mevcut enerji ihtiyaçlarını karşılarken, zarar vermeyecek ve kaynakların azalmasına neden olmadan çok az zarar verebilir.