Bir kromozomda, genler, kromozom boyunca doğrusal bir şekilde düzenlenir, ancak kromozomlar, hücre bölünmesi sırasında yalnızca homolog çiftlere hizalanır. Mitoz sırasında (tipik hücre bölünmesi) merkezcil merkezler denilen örgüt merkezlerinin eylemi.
Bir kromozom teknik olarak DNA'nın doğrusal bir telidir. Bununla birlikte, bu DNA, histonlar adı verilen özel protein kompleksleri tarafından nükleozom adı verilen yapılara sıkıca sarılır ve hücre bölünmesi sırasında daha da yoğunlaştırılır. Sonuç olarak, DNA birçok kez sarılır ve bükülür ve yoğunlaştırılmış kromozom boyunca bir genin konumu, açılmadığında kromozom boyunca tam konumunu yansıtmayabilir. Kromozomun omurgasını ve DNA'nın etrafına sardığı histonları oluşturan iskele kromozomlar arasında tutarlıdır, bu yüzden homolog genler tam olarak çiftleşmiş kromozomlarda sıralanırlar.
