Bazı aerobik bakteri örnekleri arasında tüberküloza neden olan Mycobacterium tuberculosis, Nocardia cinsinde bakteri, nokardioza neden olan bakteri ve pnömoni, idrar yolu enfeksiyonları ve gastrointestinal sorunlara neden olan Psuedomonas aeruginosa vardır. Bakterilerin oksijen bazlı metabolizmaları vardır ve oksijen olmadan yaşayamazlar.
Anaerobik bakteriler oksijen gerektirmez. Anaerobik ve aerobik bakteriler arasındaki farklar, bir kültür ortamına yerleştirildiğinde görülebilir. Aerobik bakteri, azami oksijene maruz kalacak şekilde sıvı ortamın yüzeyinde toplanır. Bazı bakteriler oksijen kullanabilir, ancak buna ihtiyaç duymazlar; diğer türler hiç serbest oksijen varlığında hayatta kalamazlar.
