İnsanlığa en zararlı mikroorganizmaların bir kısmı Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium ve Pseudomonas aeruginosa'dır. Hastalığa neden olan mikroorganizmalar patojen olarak adlandırılır.
Tüm bakteriler, çoğu protozoa ve bazı mantarlar mikroorganizmalardır. "Mikroorganizmalar" terimi, bir mikroskop yardımı olmadan insan gözüyle görülemeyen bir yaşam biçimini belirtmek için kullanılır. Bunlar tek bir hücre olabilir veya birçok hücreden oluşur. Dünyadaki her tür ortamda mikroorganizmalar var, ancak zararlı olanlardan daha faydalı mikroorganizmalar var. Genetik mühendisliği, daha büyük organizmalarda spesifik özellikler yaratmak için mikroorganizmaların manipülasyonunu içerir.
