Yemek borusunun tek salgılanması, yağlama için mukustur. Yemek borusu herhangi bir sindirim kimyasalı salgılamaz, çünkü rolü farenksten mideye yiyecek bolusları vermek.
Mukus, mukozada yer alan ve yemek borusu astarı olan mukoza bezleri tarafından üretilir. Bu astar aşındırıcı gıdalardan kaynaklanan travmaya dirençli tabakalı skuamöz epitelden oluşur. Yutma sırasında, yiyeceklerin bolusları yemek borusunu dağıtarak mukusun mukoza bezlerinden eksprese olmasına neden olur. Peristaltik kasılmalar daha sonra yiyeceği mideye doğru iter. İnsanlarda, bolus yiyeceklerin yemek borusundan geçmesi dört ila beş saniye sürer.