Bazı bitki türlerinin yumurtalıklarında tohumlar yapılır. Her bitki tohum üretme yeteneğine sahip değildir. Sadece bölümlerde bulunanlar Cycadophyta, Ginkgophyta, Gnetophyta, Coniferophyta ve Anthophyta, üreme için tohum kullanırlar. Ana bitkinin yumurtasından ve baba bitkisinin polen tanesinden elde edilirler.
Dişi bitkinin yumurtunda üretilen bir tohum birkaç bölümden oluşur. Embriyo daha sonra olgun bir bitkiye dönüşen yapıdır. Ana bitkiden bir kromozom seti ve ikinci bir babadan set içerir. Embriyonun dört ana bölümü vardır. Kotiledon, gıda depolayan bir tohum yaprağıdır, plumule ve hipokot embriyo bitkisinin gövdesi ve sürgünleridir ve kök, daha sonra bitkinin kökünde gelişir. Embriyoya ek olarak, tohum anneden diğeri de babadan iki kromozom seti içeren endosperm içerir. Endosperm, bitkiye, ufak bir bitkiye dönüştüğü için bir besin kaynağı sağlar. Hem embriyo hem de endosperm, ana bitkinin dokusunun embriyo torbasından gelişen bir tohum kabuğunda kapsüllenir. Tohum kabuğu embriyoya ve endospermin zarar görmesini engellemekten daha sert, koruyucu bir tabakadır.