Bir soğan hücresinin işlevi, bir soğanın biyolojik işlemlerini düzenlemektir. Soğan, diğer karmaşık organizmalar gibi, farklı hücrelere sahiptir. Yaprak ve çiçeklerini oluşturan hücreler, soğan ampulünü oluşturan hücreler ve köklerini oluşturan hücreler vardır.
Bitkideki soğan hücresinin türü, hücrenin ürettiği proteinler tarafından belirlenir. Pek çok canlıda olduğu gibi, soğanın DNA'sı bitkinin ürettiği tüm proteinler için plan oluşturur.
Bir bitki hücresi olarak, soğan hücresi bir hayvanın hücresinden farklıdır. Birincisi, bir hayvan hücresinin olmadığı hücre zarını çevreleyen bir hücre duvarına sahiptir. En azından bazı soğan hücrelerinde fotosentezin gerçekleştiği kloroplastlar bulunur. Fotosentez, tesis için yakıt oluşturur.
Bir soğan hücresinde ayrıca hücrenin enerji santralleri olan mitokondri vardır. Soğan hücreleri ayrıca proteinler, DNA ve nükleoli içeren çekirdeklere sahiptir. Hücreden ihraç edilecek karbonhidratları ve proteinleri hazırlayan düz gövdeler olan Golgi gövdeleri de vardır. Vakuol ve ribozom adı verilen geniş, sulu alanlar vardır. Ribozomlar, DNA tarafından yapılan proteinlerin planlarını kopyalayan RNA içerir. Her şey sitoplazma denilen jöle benzeri bir madde içinde yüzer.
