North Dakota State University'den gelen sınıf kaynaklarına göre, proteinler çift sarmallı bir DNA molekülünün çözülüp ayrılması rolünü oynar. Proteinler gereklidir, çünkü DNA tek sarmallı olmadıkça çoğalamaz.
Kuzey Dakota Eyalet Üniversitesi sınıf kaynakları, DNA replikasyonuna katılan altı protein olduğunu belirtir. Bu altı protein, DNA'yı ayırmak için belirli bir düzende çalışır. İşlem kronolojik sırada açıklanmıştır. İlk olarak, DNA helikaz çift sarmallı DNA molekülüne bağlanır ve ayırma işlemine başlar. İkincisi, DNA tek iplikli bağlanma proteinleri DNA molekülüne bağlanır ve tek iplikli yapıyı stabilize eder.
Kuzey Dakota Eyalet Üniversitesi sınıf kaynakları, bu proteinler tek zincirli DNA'ya bağlandığında DNA replikasyonunun 100 kat daha hızlı olduğunu iddia ediyor. Daha sonra, DNA gyrase, çözme işlemine yardımcı olduğu düşünülen bir işlem olan süper bobinlerin oluşumunu katalize eder. Daha sonra, DNA polimeraz I ve II, polimeraz aktivitesini okur ve onarırken DNA polimeraz III, polimeraz fonksiyonunu yerine getirir. Daha sonra primaz, serbest bir hidroksil grubu ihtiyacını karşılamak için RNA primerlerini sentezler. RNA primerinin uzaklaştırılması ve sentezleme işleminin geciken iplikçik üzerinde ilerlemesi nedeniyle bir DNA molekülünün oluşumunda nickler oluşabilir. Bu sorunu çözmek için, DNA ligazı hidroksil ve fosfat grupları arasında yapılan tüm çentikleri birbirine bağlar.