Bir proteinin ikincil yapısı, amid gruplarının moleküller arası ve molekül içi hidrojen bağları ile korunur. İkincil protein yapısının, 1951'de Linus Pauing ve Robert Cory tarafından alfa sarmalına veya beta kıvrımlı bir levhaya sahip olduğu önerildi.
Pauling ve Cory, röntgen fotoğraflarını çektikten ve moleküler modeller oluşturduktan sonra önerilerini yaptılar. Alfa sarmal yapısı, polipeptit zinciri, bir yay gibi sarılır ve sağ veya sol elle kullanılabilir. Beta kıvrımlı levha yapısında, protein zincirleri diğer tüm protein zincirlerinin yanında ters yönde yan yana sıralanır.