Hava kirliliği bitkileri asitlendirme, ötrofikasyon ve yer seviyesi ozonu gibi çeşitli şekillerde etkiler. Kimyasallar, bitki örtüsüne zarar verebilecek bileşikler oluşturmak için hava ile reaksiyona girerler. Sülfürik asit dahil olmak üzere hava kirleticileri, bulutları oluşturan su damlacıkları ile karışır. Ortaya çıkan asidik yağmur, ağaçlar, balıklar, hayvanlar ve diğer organizmalar için zararlıdır.
Hava kirliliği bitkilerde, ağaçlarda, bitki örtüsünde ve süs bitkilerinde kayıplara neden olur. Ticari ve sınai faaliyetler insan ve bitki üzerinde ciddi etkileri olan hava kirliliğine yol açmaktadır. Hava kirliliğinin bitkiler üzerindeki etkileri çeşitli şekillerde belirgin olabilir. Yeşillik, zamanla nekrotik lezyonlar gibi görünen yaralanmaları geliştirir. Yaprakların sararması (kloroz) ayrıca asitleşmenin bir etkisi olabilir. Diğer belirtiler arasında beneklenme, bronzlaşma, kızarıklık ve bodur büyüme sayılabilir. Sülfür dioksit ve azot oksitler, atmosferdeki suyla birleştiğinde, toprak ve sarhoş suları zehirleyerek bitkilere zarar veren asit yağmuru oluştururlar. Asit yağmuru, ağaçları tahrip ederek ağaçları zayıflatır, kendileri için mevcut besinleri azaltır. Topraktan salınan toksik maddeler de bitkileri zehirler. Asit su, topraktaki besinleri ve diğer önemli mineralleri eritir ve bitkiler tarafından tüketilmeden önce onları temizler. Ek olarak, üst atmosferdeki Ozon delikleri, güneşten Dünya'ya ultraviyole radyasyonun aşırı sızmasına izin vererek bitkilere zarar verir. Benzer şekilde, düşük atmosferdeki Ozon, stomaları tıkayarak bitkinin solunumunu engeller ve bitkinin fotosentez oranlarını engeller, böylece bitkinin büyüme kabiliyetini engeller.
