Protein metabolizmasının son ürünü tipik olarak amonyak, üre veya ürik asit şeklinde azotlu atıktır. Vücuttan uygun şekilde atılmazsa, bu maddeler vücudun sistemlerinde birikebilir. ve sağlık sorunlarına neden olur.
Azot biyolojik fonksiyonlar için esastır ve protein metabolizması yoluyla kullanılması atık ürünler verir. Ürik asit, yiyeceklerde bulunan, pürinler olarak bilinen maddelerin parçalanmasıyla üretilir. Amonyak, vücut yeni yaşamın yaratılması için gerekli olan genetik materyaller olan amino asitlerin ve nükleotitlerin sentezini gerçekleştirdiğinde üretilir. Bu maddelerin birikmesi gerektiğinde vücudun boşaltım sistemi yoluyla uzaklaştırılır.