Pepsin inaktif formunda salgılanır, pepsinojendir, çünkü proteinleri parçalamak için güçlü bir ajandır ve böylece hem vücudun hem de vücudun korunmasız kısımları için risk oluşturur. Pepsin bir protein bileşiği ve enzimin laboratuvar örnekleri kendi kendine sindirimi önlemek için soğuk tutulmalıdır.
Pepsinojen, midenin asidik ortamı ile temas ettiğinde pepsine dönüştürülür. Bağırsaklara geçtikten sonra, mide asitleri nötralize edilir ve pepsin tekrar inaktif hale gelir. Pepsin, mide içeriğinin özefagusa sızdığı mide reflü durumlarında hasara neden olur.
Pepsin, proteinleri tamamen parçalamaz ve midede proteinin parçalanmasına yardımcı olan üç enzimden sadece biridir. Amino asitler ve diğer protein fragmanları, bir kez mide tarafından salınan ince bağırsak tarafından emilecek kadar küçüktür. Küçük bir miktarda pepsin mideden kan dolaşımına girer ve burada ince bağırsak tarafından emilen daha büyük protein parçalarını parçalamaya devam eder.
Pepsin ticari uygulamalara sahiptir ve genellikle domuz midesinden toplanır. Deri endüstrisinde, tabaklamadan önce tüyleri ve dokuları deriden çıkarmak için kullanılır.
