Ökaryotik bir hücrede hücre işlevlerini yöneten organel, çekirdeğidir. Çoğu ökaryotik hücre, tek bir çekirdeğe sahiptir; Ancak, bazı organizmaların hücre başına birkaç çekirdeği olabilir.
Hücre çekirdeği genellikle küresel biçimdedir. Nükleer zarf, çekirdeği korur ve sadece belirli maddelerin sitoplazma arasında geçmesine izin verir. Çekirdeğin içinde hücrelerin yaşlanmasında bazı rol oynayan küresel bir yapı olan nükleol vardır.
Bu merkezi organelinin işlevi beyninkine benzerdir; hücrenin geri kalanından bilgi alır ve hücre büyümesinden protein yapımına kadar farklı hücresel aktiviteleri koordine eder. Çekirdek ayrıca hücrenin kalıtsal materyalini, DNA'sını da içerir.