Bir mikroelektrot, sinir sinyallerini izlemek veya doku uyarımı sağlamak için ayrı bir hücreye yerleştirilecek kadar küçük, çok küçük bir elektrottur.
Mikroelektrotlar, elektrik sinyallerini potasyum klorür gibi iletken bir solüsyonla doldurulmuş küçük cam kılcal damarlardan ileterek çalışır. Gümüş klorür kaplı gümüş teller de bu amaçla kullanılabilir.
Bir mikroelektrot ucu, çap olarak bir mikrometreden daha az, genellikle bir hücrenin plazma membranına zarar vermeden nüfuz edebilecek kadar küçüktür. Hücrede, dinlenme veya aktif durumda meydana gelen farklılıklar, mikroelektrot tarafından tespit edilebilir ve osiloskop gibi bir ölçüm cihazına iletilebilir. Çözünmüş oksijen, pH ve iyon seviyeleri de mikroelektrot tarafından tespit edilebilir ve iletilebilir.
Bireysel olarak kullanılabilmelerine rağmen, mikroelektrotlar bir dizi formatında da kullanılır. Farklı ayrı hücrelere birden fazla birim eklenebilir.
Bu teknolojinin pratik bir örneği mikroelektrot kaydında bulunur. Bu, beyin cerrahlarının, Parkinson hastalığının tedavisinde kullanılan derin beyin simülatörlerini yerleştirmek için en iyi yeri doğru bir şekilde belirlemelerini sağlar. Koklear implantlar ve kalp pilleri gibi vücuda implante edilen diğer nörostimülatörler de mikroelektrotları kullanır.