Mikrobiyal antagonizm, yabancı türlerin girmesini engellemek için yerleşik mikroorganizma kültürlerini kullanma yöntemidir. Daha önce kolonileşmiş bir ortama girildiğinde, istilacı bir bakteri türü gelişmez ve gidebilir tamamen tükenmiş.
İnsan vücudundaki mikrobiyal antagonizmanın bir örneği, yerleşik ağız bakterilerinin ağızdan ağıza temas yoluyla getirilebilecek yeni suşlara direncidir. Bir öpücükten sonra, örneğin, yabancı bir ağzın düşmanca ortamına yeni bakteriler sokulur. Bir kez orada, istilacı bakterinin büyümesi, doğal flora tarafından salgılanan antimikrobiyal bileşiklerin yanı sıra kaynaklar için sıkı rekabete girerek inhibe edilir.
