Meksika’nın en büyük su kütleleri; Kaliforniya Körfezi (yerel olarak Mar de Cortés olarak bilinir), Meksika Körfezi, San Juan Nehri ve Chapala Gölü (en büyük tatlı su gölü). >
Kaliforniya Körfezi ayrıca Cortez Denizi ve Vermilyon Denizi olarak da bilinir. Kaliforniya yarımadasını Meksika'dan ayırdığı ve 4.000 kilometrelik bir sahil şeridine sahip olduğu için büyük bir su kütlesi olarak kabul edilir. Meksika Körfezi 1.500 kilometre genişliğindedir ve Meksika, Küba ve ABD'nin Teksas, Louisiana, Mississippi, Alabama ve Florida eyaletleriyle sınırlıdır. Meksika'nın en büyük tatlı su gölü olan Laka Chapala, Chapala, Jocotepec, Jamay, Jalisco ve Poncitlan belediyelerinde yer almaktadır. Bu adı taşıyan dünya çapındaki pek çok nehirden biri olan San Juan Nehri, Nuevo Leon'a su sağladığı için büyük bir nehir olarak kabul edilir.
Bunlar Meksika'daki başlıca su kütleleri olsa da, ülkenin ayrıca daha küçük gölleri, göletler, nehirler ve koyları vardır. Basaseachic Nehri'ndeki Basaseachic Şelalesi, Meksika'daki en yüksek ikinci şelaledir ve Piedra Bolada Şelalesi en yüksektir. Meksika'daki nehirlerin ve göllerin çoğu çiftçiler tarafından kullanılıyor veya popüler turistik yerler.
