Mantarlar ekosistemlerde önemli bir rol oynar. Organik maddenin ayrışmasından sorumludurlar; Yerdeki organik maddenin sökülmesi ve geri dönüşümü, böylece Rainforest Conservation Fund'a göre bitkiler için besin ve gıda sağlar. Ek olarak, mantarlar toprak içindeki azot fiksasyonundan sorumludur.
Biyosfer içinde mantarlar, birincil ayrıştırıcılar ve besin geri dönüşümü yapanlar için önemli bir rol oynar. Mantarlar var ve bu rolü tüm Dünya yaşam alanlarında. Mantarlar olmadan, bitkiler mantarlar tarafından geri dönüştürülen organik madde olan birincil besin kaynaklarını kaybederler. Mantarlar ayrıca, çeşitli diğer organizma türleriyle ortak rol oynarlar.
Azot tespiti, ekosistemdeki mantarların bir başka önemli katkısı, Science dergisine göre. Mantarlar tarafından yapılan azot fiksasyonunun, yaprak kesici karıncaların biyokütlesine simbiyotik bir ilişkinin parçası olarak katkıda bulunduğu gösterilmiştir.
Mantarların siyanobakteriler ve yeşil alglerle karşılıklı ilişkiler kurduğu ve böylece liken oluşturduğu bilinmektedir. Benzer karşılıklı ilişkiler, çeşitli böcek türleri ile oluşturulmaktadır. Bu bakteri ve böceklerin olumlu katkısı, mantarların biyosferde oynadığı avantajlı rolleri göstermektedir.
Bazı mantarlar insanlarda hastalıklara neden olurken, diğerleri besinleri geri dönüştürerek ve diprit ve topraktan bitkisel gıda üreterek hayatta kalma kabiliyetimizi önemli ölçüde ve olumlu yönde etkiler.