Mantarın kısımları kapak, solungaç veya gözenekler, sporlar, gövde, halka, volvo, miselyum ve hiflerdir. Mantar yeraltı ve yer altı bölümlerine ayrılabilir.
Mantarın kapağı en üst kısımdır. Konik, düz veya küresel olabilir ve mantar tipine ve gelişim aşamasına bağlı olarak çeşitli dokulara sahip olabilir. İşlevi, kapağın altında bulunan ve yan yana istiflenmiş ince, kağıt benzeri katmanlardan oluşan solungaçları korumaktır. Bazı mantarların solungaç yerine gözenekleri vardır. Bunlar bir süngere benzeyen sıkıca birbirine sarılmış küçük tüplerdir. Solungaçlar ve gözenekler mantarı yeniden üreten element olan sporlar üretir.
Mantarın sapı kapağı destekler ve belirli tiplerde bulunmayabilir. Mantarın halkası, gövdenin üst kısmında bulunur ve kapak büyüdükçe parçalanan solungaçlar için koruyucu bir kaplama kalıntısıdır. Sapın dibinde, bir zamanlar bütün mantarı koruyan benzer bir kalıntı vardır. Mantarın yeraltı kısmı miselyumdur. En dibinde mantar için su ve organik madde toplayan kök benzeri beyaz filamentler olan hypha vardır.