Kömür madenciliğinin temel dezavantajı, madencilikle uğraşanların sağlığına çok zararlı olmasının yanı sıra çevre üzerinde de ciddi olumsuz etkileri olması Sonunda tükenecek yenilenemez bir enerji kaynağıdır, bu da kalıcı bir enerji kaynağı olamayacağı anlamına gelir.
Her yıl binlerce madenci mayınların çökmesi, patlamalar ve "kara akciğer" olarak adlandırılan solunum yolu hastalıkları nedeniyle ölüyor. Kömür madenciliği sıklıkla insanlar ve hayvanlar için hayati önem taşıyan ekosistemlerin yıkımına yol açan taşma ve erozyona neden olmaktadır. Kömür madenciliğinden kaynaklanan toksinler ve kimyasallar genellikle çevreye, hayvanlarda ve insanlarda olduğu gibi çevreyi daha da engelleyen toprağa, havaya ve suya salınır.