Klonlama, geniş ölçüde insan güvenliği için endişe ve uygunsuz veya etik dışı hayvan muamelesiyle ilgili endişe olarak sınıflandırılmış çeşitli nedenlerle tartışmalar yaratır. Klonlama, parlak renk, daha büyük boy veya daha yumuşak kürk gibi bazı özellikleri geliştirmek veya oluşturmak için biyolojik prosesleri değiştirmek için bazılarından direnç alır. Bazıları, bu değişikliklerin biyolojik normlarla çeliştiğini ve genetiği değiştirilmiş organizmalara maruz kalan insanlar ve diğer hayvanlar için hastalık ve hastalık riski oluşturduğunu iddia ediyor.
Klonlama, hayvan ve bitki replikasyonu bağlamında eleştiri çizer ve insanlara uygulandığında daha da fazla eleştiri davet eder. Bazı araştırmacılar ve bilim insanları, bazı hastalıkların yok edilmesi ve bağışıklamanın kolaylaştırılması için klonlama övgüde bulunurken, diğerleri hastalık direncini ve yeni alerjilerin referans noktası olarak geliştiğini belirtmektedir. Örneğin, bazı araştırmacılar, besinler ve antibiyotiklerle takviye edilmiş klonlanmış hayvanların sütün içilmesinin, yoksul bölgelerdeki hastalığın yayılmasını kontrol altına aldığını ve geleneksel aşılardan daha etkili ve daha ucuz olduğunu kanıtladığına inanıyor.
Hayvan refahı savunucuları gibi diğerleri, güvenlikle ilgili soruları gündeme getiren, yıllarca sürecek bilimsel çalışmalara dayanmayan deneysel olarak hareket etmelerine dikkat eder. Klonlama, bazı biyologlar arasında, yapay gen seçimi ve değiştirilmesinin bazı türleri değiştirdiği, genetik çeşitliliğin zamanla azalması nedeniyle onları mutasyonlar, kusurlar ve hatta tükenme riski altında bıraktığı endişesiyle eleştirmektedir.