Kaplumbağalar farklı şekillerde ayaklar, kabuklar ve ağızlar geliştirerek çevrelerine adapte olmuşlardır. Suda yaşayan kaplumbağalar genellikle düzleştirilmiş kabuklara sahipken, karada yaşayanlar genellikle yuvarlak kabuklara sahiptir. Kaplumbağaların ayakları habitat seçimini yansıtır, çünkü ayaklar genellikle su türlerinde ve karasal türlerde fil benzeridir. Kaplumbağaların diyetlerine uygun ağızları vardır.
Yumuşak kabuklu kaplumbağalar ve Fly River kaplumbağaları gibi en iyi yüzme kaplumbağalarının bazıları çok düz mermilere ve perdeli ayaklara sahiptir. Deniz kaplumbağaları, sudaki adaptasyonu daha da ileri götürür ve küreklere indirgenmiş uzuvları vardır. Çamur ve misk kaplumbağaları gibi birçok su kaplumbağası hayatta kalmak için yeterince yüzebilir, ancak göllerin, nehirlerin ve bataklıkların dibinde yürümek için daha uygundurlar. Uzun mesafelerde seyahat etmek zorunda olan karada yaşayan kaplumbağalar, ağır vücutlarını taşımak için iyi adapte edilmiş sütun benzeri ayaklara sahiptir.
Büyük av yiyen kaplumbağalar tipik olarak çok büyük ve güçlü ağızlara sahiptir. Kıvrılan kaplumbağalar, balıkları ve diğer kaplumbağaları çekmelerini sağlayan geniş, keskin kenarlı gagalara sahiptir. Buna karşılık, garip Güney Amerika tatlı su kaplumbağası, mata mata adını verdi ve balıkları ağzına emerek avlanıyor. Buna göre, ağzı güçlü emiş kuvvetleri oluşturmak için gelişti.
