İyot ve nişasta etkileşime girdiğinde, iyot molekülleri nişasta molekülleri içinde doğrusal bir şekilde düzenlenir. Bu düzenlemenin görünen sonucu, mavi-siyah renklendirmenin görünümüdür.
Patates gibi doğal nişastalar, iki fraksiyonun kombinasyonlarıdır: amiloz ve amilopektin. Amiloz, iyot ile reaksiyonu bir masal indigo tonu üreten belirli bir fraksiyondur. Dal şeklindeki amilopektin moleküllerinin aksine, amilozun yapısı, glikoz birimlerinin uzun polimer zincirlerini birleştiren asetal bağları içerir ve moleküllerine daha fazla doğrusal bobin şekli verir.Amiloz, lineer triiodid iyon komplekslerini, bobin şeklindeki moleküllerinin merkezi oluğu içine zorlar. İyot ve nişasta arasında oluşan müteakip yük transferi, elektronların sınırlandırılma şeklini ve buna bağlı olarak enerji-seviyeli aralıklarını değiştirir. Yeni enerji seviyesi aralığı, görünür ışığı seçici olarak absorbe etmek ve mavimsi bir renk tonu oluşturmak için yeterlidir.
Bu reaksiyonun gerçekleşmesi için mevcut iyot ve iyodür iyonları bulunmalıdır. İkisinin bir kombinasyonu, pozitif yüklü protonlardan daha negatif yüklü elektronlara sahip olan bir anyon verir. İyot ve iyodür iyonlarının kompleksi de suda çözünürdür ve bu çözünürlük, amiloz molekülleri içinde bağlanan lineer triiyodit iyon komplekslerinin oluşumu için gereklidir.İyot ve iyodür iyon kompleksleri de amilopektin moleküllerine bağlanır, ancak amilopektin moleküllerinin dallanmış şekli, bağlanma derecesini sınırlar. Bu sınırlı ciltleme tipik olarak çıplak gözle mor veya pas renkli bir çözelti olarak kaydedilir.
