Kısmi egemenlik olarak da bilinen eksik egemenlik, iki allel protein ürettiğinde gerçekleşir, ancak biri olması gerektiği gibi çalışmaz. diğer zamanlarda doğum kusurlarının veya bebek ölümlerinin önde gelen nedenidir.
Bu tür bir gen ifadesinin, insanlarda görülmesi diğer organizmalardan daha zor olabilir. Eksik baskınlık göstermek için kullanılan yaygın bir örnek, aslanağzı yapraklarındaki renktir. Kırmızı ve beyaz bir çiçeğin genleri bir araya getirildiğinde, kırmızı çiçekler için bir tane ve beyaz için bir tane vardır. Eksik baskınlığın ifadesi, çiçek açan çiçekler pembe olduğunda görülür.
