Bir ineğin midesi, kendi kimyasal işlemlerine ve biyolojik fonksiyonlarına sahip dört farklı oda içerdiğinden, inek gübresinin kimyasal bileşimi, çeşitli farklı maddeler içerir. Bu maddeler arasında mikroorganizmalar, sindirim ürünleri, sindirim sisteminin farklı bölümlerinden salınım ve mide odaları ve su gibi şeyler bulunur. Bütün bu farklı bileşenlerden, gübre temel olarak ölü organik hücreler ve sindirilmemiş besinlerden oluşur.
Bir ineğin midesi ve sindirim sistemi, çeşitli işlevleri yerine getiren bölmelere ve bağırsak bölümlerine bölünür. Bazı odalar gıda parçalama işlemine fermantasyon ve mikroorganizmalarla başlar, diğerleri su ve diğer mineralleri emer. Bu karmaşık adım dizisi nedeniyle, ineğin sindirim sürecindeki her aşama, gübrenin kimyasal yapısına farklı kimyasallar ve maddeler ekler.
İnek gübresinin ana bileşenleri, canlı dokunun metabolik kalıntıları ve yiyeceklerin selüloz ve lignin gibi sindiremediği kısımlarıdır. Bu sindirilmeyen maddeler genellikle ineğin tükettiği bitki hücrelerinin hücre duvarlarından gelir. İnek gübresinin bileşiminde bulunabilecek diğer materyal örnekleri arasında safra tuzları, mukus, keratinize doku ve yağ asitlerinden kalsiyum tuzları bulunur.
