Adli bilimde, uyuşturucu kullanımını tanımlamak, farklı bomba tozları arasında ayrım yapmak ve farklı maddelerin kimyasal bileşimini vurgulamak için kromatografi kullanılır. Madde hemen veya kesin bir teste geçmeyi kolaylaştırır.
İnce tabaka kromatografisi kullanarak, bilim adamları banka soyguncularını izleyebilirler. Bazı bankalar, soygunlara götürdüğünde küçük bir bomba gibi patlayan nota demetlerinin ortasına kırmızı boyalar yerleştirir. Birisi bir bankayı soyduğunda, anlatan kişi bu paketlerden birinin onlara teslim edilmesini sağlar. Bu kırmızı boya patlar ve soygunun suçlu olduğunu gösterse de, boya ile diğer kırmızı lekelenme kaynakları arasında ayrım yapmak için kromatografi gerekir. Başka hiçbir boya, bir bankanın kullandığı bileşime sahip olmadığından, bunun kanıtı bulmanın basit bir yoludur.
Silah ve bomba tozları arasında ayrım yapmak için kromatografi de kullanılır. Kimyacılar tozu bir çözücüye batırır ve bu da daha küçük parçalara parçalanmalarına neden olabilir. Daha küçük kurucu parçalar daha sonra bir borunun içine ve dışına hareket etmelerini sağlayan kuvvetlere veren yüksek performanslı bir sıvı kromatografi makinesine yerleştirilir. Bu maddelerin hareket etme hızlarını ve tespit edilen tutma sürelerine karşı ölçümlerini kaydederek, toz tipini belirlemek mümkündür.İlaç testi, adli bilimlerde yaygın bir kromatografi uygulamasıdır. Bilim adamları, özütleri silika materyale yerleştirip bir çözücüye yerleştirerek, bilim adamları moleküllerin hareketini izleyebilir ve bilinen ilaç düzenlerine karşı ölçebilirler.