İyot pentaflorür olarak da bilinen IF5'in moleküler geometrisi, merkezi bir iyot atomunu çevreleyen kare tabanlı bir piramittir. Piramidin her köşesi bir florin atomudur.
Moleküldeki bağların her biri arasındaki açı, piramidin tabanını oluşturan dört florin atomu için 90 derece ve piramidin noktasını oluşturan tek florin atomu için 180 derecedir. İyot pentaflorürün iki boyutlu yapısı, yıldız işaretine benzeyen yıldız şeklinde beş flüorit atomu ile çevrili merkezi bir iyot atomu olarak yazılmıştır, ancak bu kolaylık sağlamak içindir ve molekülün veya bağ açılarının gerçek şekline karşılık gelmez .
Brom pentaflorür, iyot pentaflorür ile çok benzer bir şekle sahiptir.