Hipotalamus, birçoğu homeostaz olmak üzere çeşitli işlevler gerçekleştirir. Diğer işlevler, hipofiz bezi ve böbreküstü bezi de dahil olmak üzere bazı bezlerin hormon üretimi ve kontrolüdür. Homeostaz, vücudun dengeli bir sıcaklık, solunum ve kan basıncı gibi otonom süreçleri nasıl kontrol ettiğidir.
Hipotalamus inci boyutundadır ve uykudan uyanma döngüsü ve motor işlevi gibi diğer işlemlerde rol oynar. Hipotalamus, hormon yapımındaki rolü nedeniyle, özellikle açlık, cinsel dürtü, ruh hali ve susuzluk alanlarında bir insanın duygularını etkileyebilir. Hipotalamus, çeşitli otonom sistemlerde ayarlamalar yapmak için bir vücut set noktası kullanır.