Bir hidrojen iyonu, elektronundan izole edilen bir hidrojen iyonu çekirdeğini belirtir. Terim ayrıca su çözeltilerinde hidrojen iyonu için de kullanılır.
Bir hidrojen atomunun çekirdeği, proton adı verilen pozitif yüklü bir parçacıktan oluşur. Bu nedenle, sembolü H + olan hidrojen iyonu bir protonu temsil eder. İzole edilmiş hidrojen çekirdeği diğer parçacıklarla kolayca birleşebildiğinden, izole edilen hidrojen iyonu ancak neredeyse partikül olmayan bir alanda veya gaz halinde bulunabilir. Ayrıca, bir su çözeltisindeki hidrojen iyonu miktarı, asitlik seviyesini hesaplamak için kullanılır.