Pepsin, midedeki proteinleri parçalayan bir sindirim enzimidir. Bu sindirim enzimi midede pepsinojen olarak üretilir, ancak midenin asidik ortamıyla karşılaştığında hızla pepsine dönüşür.
Pepsinojen, midenin baş hücreleri tarafından salgılanır. Midede ayrıca, lipitler mideye girdiğinde gastrik lipaz denilen bir enzim salgılar. Gastrik lipaz bu lipidleri parçalamaktadır. Yiyecekler daha küçük bileşenlere ayrıldığında, peptidazlar, sükraz, maltaz, laktaz ve bağırsak lipaz gibi diğer sindirim enzimlerinin parçalanmaya devam ettiği ince bağırsaklara hareket edebilir. Bununla birlikte, kalın bağırsak, sindirim enzimleri üretmez.